增值电信业务EDI许可证的办理确实存在一定的难度，且容易被驳回申请。以下是对其难办理原因及被驳回申请处理方法的详细分析：

一、EDI许可证难办理的原因

1.严格的申请条件：

-注册资本要求：申请者需在省、自治区、直辖市范围内经营的，注册资本最低限额为100万元人民币；若在全国或跨省、自治区、直辖市范围经营，则注册资本最低限额为1000万元人民币。

-公司资质要求：申请者必须是在中国大陆境内依法注册的公司，且建议为纯内资公司。若含有外资成分，则需走外资审批流程，流程相对复杂。

-专业人员要求：申请者需提供3名员工近一个月的社保缴纳证明，以满足对专业人员的要求。

-经营范围要求：公司营业执照经营范围中必须包含“电信业务”字样。

-网站要求：申请者的网站内容必须符合要求，否则可能被审批单位退回。

2.复杂的审批流程：

-EDI许可证的办理涉及多个部门的审批和监管，流程相对复杂，需要申请者耐心准备和积极配合。

-审批周期可能较长，申请者需要耐心等待。

3.法规政策的不断变化：

-互联网行业快速发展，相关的法规和政策也在不断更新和调整，申请者需要时刻关注新的法规和政策变化，确保申请材料的合规性和时效性。

二、被驳回申请的处理方法

1.仔细研究驳回原因：

-当申请被驳回时，首先需要仔细研究驳回通知中的具体原因。这通常包括申请材料不齐全、格式不符合要求、内容有误、注册资本不足、业务计划书不完善、网站备案信息不完整、网络与信息安全保障措施不足，或股东结构不符合规定等。

2.修改和完善申请材料：

-根据驳回通知中提到的问题，仔细检查和修改申请材料。确保所有材料齐全、格式正确、内容准确，并符合相关法规和政策的要求。

-特别注意注册资本、业务计划书、网站备案信息以及网络与信息安全保障措施等方面的要求。

3.寻求专业帮助：

-如果对申请流程和材料要求不太了解，可以寻求咨询服务或代理机构的帮助。他们通常具有丰富的经验和知识，能够帮助企业更好地准备申请材料，提高申请成功率。

4.关注法规政策变化：

-由于互联网行业的快速发展，相关的法规和政策也在不断更新和调整。因此，需要时刻关注新的法规和政策变化，确保申请材料的合规性和时效性。

5.重新提交申请：

-在解决了所有问题并准备好了所有材料后，可以再次提交申请。请注意遵守相关的法律法规和程序要求，确保申请的合规性和有效性。

6.耐心等待和积极配合：

-由于审批流程的复杂性和严格性，申请者需要耐心等待审批结果。同时，在审批过程中，应积极配合审批部门的要求，及时提供补充材料或说明情况。

综上所述，增值电信业务EDI许可证的办理确实存在一定的难度，但只要申请者认真准备、严格遵守相关法规和政策要求、积极配合审批部门的工作，就有可能成功获得许可。