审批不通过增值电信业务EDI许可证的主要原因通常涉及多个方面，包括但不限于以下几点：

一、申请材料问题

1.材料不齐全：申请时未按照要求提交完整的申请材料，如缺少营业执照副本、法人身份证明、注册资金证明等关键文件。

2.格式不符合要求：提交的申请材料格式不规范，如文件大小、分辨率、命名方式等不符合审批部门的规定。

3.内容有误：申请材料中的信息填写错误或存在矛盾之处，如企业名称、注册资本、经营范围等信息与实际不符。

二、企业资质问题

1.注册资金不足：企业的注册资金未达到申请EDI许可证的最低要求（通常省内业务不低于100万元人民币，全国或跨省业务不低于1000万元人民币）。

2.经营范围不符：企业的营业执照经营范围中未包含“第二类增值电信业务”或相关电信业务字样，或经营范围与申请EDI许可证的业务类型不匹配。

3.外资成分问题：企业含有外资成分且未通过外资审批流程，或外资比例不符合相关规定。

三、技术实力与网络安全

1.技术方案不完善：申请材料中的技术方案未详细描述企业的技术实力、系统架构、数据处理能力等关键信息，或方案不符合相关标准和要求。

2.网络与信息安全保障措施不足：企业未提供有效的网络与信息安全保障措施，如未建立健全的信息安全管理制度、未采取有效的数据加密和访问控制技术等。

四、业务规划与市场前景

1.业务计划书不完善：申请材料中的业务计划书未清晰阐述企业的业务模式、市场定位、竞争优势、发展规划等关键内容，或计划书内容缺乏合理性和可行性。

2.市场前景不明朗：审批部门认为企业的业务模式或市场前景不明朗，存在较大的经营风险和不确定性。

五、其他因素

1.政策变动：在申请过程中，相关政策可能发生变化，导致原有的申请条件或要求发生调整，而企业未及时了解和适应这些变化。

2.审核流程繁琐：由于审批流程相对复杂和繁琐，部分企业在申请过程中可能因各种原因导致审核进度受阻或延误。

针对以上原因，企业在申请增值电信业务EDI许可证前，应充分了解相关政策和要求，认真准备申请材料，确保材料的完整性和准确性。同时，企业还应加强自身的技术实力和网络安全保障能力，完善业务规划和市场前景分析，以提高申请成功率。此外，企业还可以考虑寻求专业的咨询服务或代理机构的帮助，以更高效地完成申请流程并降低审批不通过的风险。